虽然这场战争早已结束并被当做黑历史被封杀，但它所造成的影响却是无法抹去的。就整个宇宙来说，战后重新建立了一个新的宇宙秩序，新的宇宙理事会（又称为宇宙安全理事会）和相应的机构相继建立了起来。独立文明联合体等五个文明成为了常任理事，最终在进行了一系列的协调之后，一个延续至今的星际格局形成了。
而战争对联合体的影响更加巨大，在战争中原本完善的体制就遭到了严重破坏，虽然在战后联合体整合了自己的全部盟友，但这些文明参差不齐的发展水平与多种多样的意.识.形.态却让联合体十分头疼。而在战后严重的经济危机更加重了内部的政治危机，随后降临的意.识.形.态危机更是将联合体变得虚弱不堪。尤其是在战后的30年当中，联合体一直都处于内战的边缘状态，幸而当时联合体内的各大势力都已经在战争中精疲力尽无力再战，同时宇宙中的其他文明也都实力大损，基本上都还处于恢复阶段，因此独联体才得以成功渡过了这段危险的时期。但联合体也再不能恢复到以前的状况了。
战后联合体的疆域和战前相比，虽然遭到了战争的摧残，但在整合掉自己全部的盟友与势力范围内的文明之花还是比战前扩大了一倍左右。但中央的权利也急剧下降，战前的民.主.集.中.制的领导方式显然不能继续维持下去了。而战争中被临时批准由各加盟文明临时建立的地方防卫部队在战后又尾大不掉，同时新加盟文明不同的意.识.形.态的也破坏了联合体在思想上的统一性。最后，中央政府不得不做出妥协，在9500年前，联合体出台了新的宪法盟约，联合体的旗帜又变回了原先建立之初的三色旗，之前强制要求的意.识.形.态统一原则也被取消、联邦议会代替了原先的宇宙文明代表大会、加盟文明获得了地方自治的权利······独联体的整个政治结构发生了根本性的转变，同时经济结构也发生了重大转变，而这种转变后的结构一直延续至今。
可以说战争对联合体的影响比理事会中的四个文明都要大得多，其他的四个虽然在战争中都遭到了打击，但还没有哪一个在战后发生了像独联体这么大的变化。在医治战争的创伤之后，他们可以继续沿着自己的道路前进，而联合体却不得不停下来花大量的时间来稳定内部。这种情况在所有有远见的联合体政治家眼中都是痛心疾首的。
当陈彦还在仔细阅读着终端机扫描下来的独联体历史时，莎卡莉娜也在认真的检查着储存在这里的灵能水晶，这些东西实在是太重要了，从某种意义上来说它们比那些在太空中的灵能水晶储藏站更加重要。因为这些灵能水晶里储存的东西都是不可再生的，一旦失去了，就真的再也找不回来了。
储存这些灵能水晶的地方远比陈彦想象的要大，除开这层之外，在它之下还有足足五十层的建筑，里面都堆满了记载着丰富历史资料的灵能水晶，通过房间尽头的电梯，可以直达储存这些灵能水晶的楼层。
莎卡莉娜独自一人漫步在储存灵能水晶楼层的最底处。在这里，顶楼存放的信息其实是最古老的，最“新”的信息反而都被收集在了最底层。
“这里也没有吗？”莎卡莉娜十分失望地将自己手上的灵能水晶放回了原处，她查遍了近三百年联合体的全部档案，但还是没有找到她所想要的东西。
“它到底在哪呢？”莎卡莉娜背靠着储存灵能水晶的箱子寻思着，“所有可能储存它们的地方我都已经找遍了，但为什么就是找不到呢？”其实她自己心里清楚，要是连这里都找不到的话，她想要找的信息大概也就只剩下两种可能了：1、当时这些信息被有意无意的没有记录下来；2、它们被彻底的删除了。但无论是哪种都只有一种结果，那就是她永远都别想找到了。
“我应该能找到的，应该吧。”她自我安慰说，但这又有什么用呢？